主要控制有生命微粒（細菌）與無生命微粒（塵埃）對工作對象的污染，其內部材料要能經受各種滅菌劑侵蝕，且一般保證正壓，也就是其內部材料要能經受各種滅菌處理的工業潔凈室。潔凈室是保證藥品質量的最后工序，防止微?；蛭⑸飳Ξa品或潔凈環境造成污染，還可以防止高活性物質通過真空抽出對環境造成的影響。

其規劃及建造必須滿足GPM對藥品、包裝儲存衛生的強制性要求，從硬件上保證降低藥品生產過程中遭到污染貨品質劣變，建立健全的保證系統。